11月26日，中国科学技术信息研究所在北京公布了2009年度中国科技论文统计结果。中国科学技术大学2009年表现不俗的论文比例再列全国高校第一。
2009年，我国机构作者为第一作者的论文共10.88万篇，其中表现不俗（超过所在学科论文被引次数的世界均值）的论文数为1.68万篇，占论文总数的15.5%，较2008年的11.5%上升了4个百分点。按文献类型分，97%是原创论文，3%是评述类文章。其中，化学、物理、数学、生物学、电子通讯与自动化等5个学科的表现不俗论文最多；水产、矿业、化工、能源、农学等5个学科产出的“表现不俗”的论文占其全部论文的比例较高。
2009年我国表现不俗的论文82%由高等学校贡献，近17%产自研究院所。中国科学技术大学2009年表现不俗的论文为345篇，占2009年我校SCI论文总数1568篇的22%，相比2008年上升了5个百分点。这一比例位居2009年表现不俗的论文全国高校第一。
中国科学技术大学2000-2009年发表的SCI收录论文累计被引用7975篇，累计被引用74314次，篇均引用次数达到9.32次，远高于中国平均水平5.87次，居全国高校之首。2000-2010年间我国发表的论文中有5779篇（含第一作者非中国机构的论文）累计被引次数进入世界前1%，被引频次超过500次的论文有10篇，中国科学技术大学陈仙辉教授于2008年发表在NATURE的论文“Superconductivity at 43 K in SmFeAsO1-xFx”至今已被引用572次。此外，中国科学技术大学另有2篇论文入选2009年“中国百篇最具影响国际学术论文”，通讯作者均是陈仙辉教授。