我校的网站群系统采用中国科学院网站群内容管理(WCM)平台建设。
2009年10月29日，中国科学院网站群正式发布运行，含159个中文子站、116个英文子站，形成了以中国科学院网站为主站、院属机构为子站的网站群体系。2010年1月，借鉴院网站群建设经验，为了进一步提高网站服务水平，网络信息中心采用中国科学院网站群内容管理平台建设中国科学技术大学网站群系统。
2010年1月，网站群系统完成了软硬件建设，3到5月间先后完成了人员培训、系统测试、管理办法制订、内容框架制订、模板制作、网站群工作网站建设等前期准备工作。6月份开始，先后启动了院系网站群和机关部处网站群两个专题。2010年9月，学校中英文主站正式切换到网站群平台运行。截止到2010年底，网站群系统已建成发布网站50，发布文章29000多篇。同时有10多个网站正在建设过程中。
2010年9月，我校网站群系统与中国科学院网站群系统的接口正式开通，我校网站群可直接向院网站群推送文章，同步资源更新量和访问量等运行数据。
2010年底，网站群系统的计数器和RSS功能也已经完成并投入使用。